Животный Мир
ГНПП «Алтын-Эмель» очень богата флорой и фауной. В парке насчитывается около 1800 видов растении, из них 29 занесены в Красную книгу РК, индикаторных видов 32. 70 видов млекопитающих, индикаторных видов 17, 11 видов занесены в Красную книгу РК. 260 видов птиц , из них 29 занесены в Красную книгу, индикаторных видов 15. 4 вида земноводных, из них 2 вида занесены в Красную книгу РК, все 4 вида являются индикаторными видами. Пресмыкающиеся 25 видов из них 1 вид занесен в Красную книгу РК, 10 видов являются индикаторными видами.Наличие видов рыб-26, в том числе число видов занесенных в Красную книгу Республики Казахстан-2, число индикаторных видов 6, Наличие видов членистоногих-6000, из них насекомые-4000, паукообразные -150, индикаторных видов -5.
Оригинальность и разнообразие флоры и растительности национального парка «Алтын — Эмель» определяется тем, что парк расположен на стыке двух флористических районов — Джунгарского Алатау и Балхаш-Алакольского. К тому же самая нижняя точка расположения парка находится ниже 500 метров, а самая высокая – около 2000 метров выше уровня моря, поэтому в пределах парка можно наблюдать практически все высотные типы растительности – от высокогорных альпийских лугов до пустынных растительных сообществ.
Во флоре национального парка «Алтын — Эмель» достоверно зарегистрировано 825 видов сосудистых растений, относящихся к 380 родам и 84 семействам, однако это еще неполные данные. Насчитывается более 60 редких и эндемичных растений, из которых 29 включены в Красную Книгу Казахстана. 6 видов растений встречаются только на территории национального парка и нигде больше в мире.
Млекопитающие парка представлены 70 видами — это около половины (43,5%) всех видов млекопитающих Казахстана. Насекомоядные составляют 6 видов, рукокрылые – 12, хищные – 20, копытные – 8, грызуны – 36 и зайцеобразные – 2 вида. 13 видов животных являются редкими, исчезающими и внесены в Красную книгу Международного Союза охраны природы (МСОП) или в Красную книгу Республики Казахстан – это каменная куница, перевязка, среднеазиатская речная выдра, манул, туркменский кулан, джейран, тянь-шанский горный баран — архар, бухарский олень, азиатская широкоушка, тянь-шанский бурый медведь, туркестанская рысь, снежный барс, лошадь Пржевальского. Тем самым в национальном парке обитают около 30% редких и исчезающих млекопитающих Казахстана. 6 видов млекопитающих национального парка имеют охотничье-промысловое значение — волк, лисица, барсук, кабан, сибирский горный козел и сибирская косуля.
Орнитофауна включает 260 видов (это более половины всей фауны птиц Казахстана – 49,4%), в том числе 148 видов птиц постоянно гнездится. Особенно широко представлены и многочисленны хищные и водоплавающие птицы, поскольку в парке обитает большое количество копытных животных и имеются крупные водоемы, как река Или и Капшагайское водохранилище. 18 видов птиц национального парка являются редкими, исчезающими и внесены в Красную книгу Международного Союза охраны природы (МСОП) или в Красную книгу Республики Казахстан – черный аист, кудрявый и розовый пеликаны, лебедь-кликун, савка, змееяд, степной орел, могильник, беркут, орлан-белохвост, бородач, стервятник, балобан, журавль-красавка, джек, чернобрюхий рябок и саджа. Это составляет около 32% от всех «краснокнижных» птиц республики.
Пресмыкающиеся парка многочисленны и включают 24 вида, из них: 8 видов змей, 15 видов ящериц и 1 вид черепахи. 2 вида змей – гадюка и щитомордник являются ядовитыми. Один вид ящериц — пестрая круглоголовка занесен в Красную книгу Казахстана.
Земноводные на территории парка представлены 4 видами: зеленая и данатинская жаба (жаба Певцова), озерная и центральноазиатская лягушки, из которых 2 вида (данатинская жаба и центральноазиатская лягушка) занесены в Красную книгу Казахстана.
Ихтиофауна Капчагайского водохранилища и р.Или включает 26 видов. Наиболее многочисленны лещ, судак, сом, жерех, белый толстолобик, сазан и белый амур. В Красную книгу Казахстана занесены илийская маринка и балхашский окунь. Ценным видом является аральский шип, редко встречающийся в реке Или в границах национального парка.
Энтомофауна национального парка, по последним данным, насчитывает около 6000 насекомых и иных беспозвоночных. Из них паукообразные 150 видов, насекомых 4000. В Республиканскую Красную книгу 1 вид зорькаэнфема. И 5 видов являются индикаторными.